ذكرت في الكتاب المقدس في سفر يشوع تحت اسم يبنئيل، بعد تدمير الهيكل في أورشليم (القدس (أورشليم)) عام 70م من قبل الرومان بعد ذلك تجمع يهود السنهدريم في يبنه ( يبنئيل) وأصبحت مركزاً مهماً لهم حيث تواجد هناك معلموهم مثل الرابي جملئيل والرابي يوحنان بن زكَّي، وبعد عام 135م  سكنها أيضاً من اليهود السامريين وكان لهم كنيس خاص بهم، دخلت المسيحية المدينة في القرن الرابع الميلادي ، تظهر المدينة في خارطة مادبا بدون سور، وفيها ثلاثة كنائس لها أسقف لونها أحمر، أكبر هذه الكنائس تقع في الوسط، وقد كانت مكرسة للقديس ستيفانوس والأخرى للقديس توما، والتي بنيت زمن الامبراطورة Eudocia   حوالي عام 440م، ذكر ذلك بطرس الأبيري، وفي زمن الفرنجة (الصليبيين) تم إعادة بنائها، وفي القرن الرابع عشر تم بناء جامع مكانها وما زال قائما حتى الآن.

يعتقد أن في “يبنه” يوجد قبر الرابي جملئيل وقبر أبو هريره، وهو من صحابة الرسول محمد، والذي تم تدميره وإتلافه، والآن لا يوجد في يبنه أية آثار مسيحية.